该剧改编自步月钱庄小说《权倾朝野的验尸官与医妃》,讲述了大理寺尚书沈仪卷入晋王案,惨遭灭门之灾。其女沈婉借用秦府九小姐秦婉的身份逃往荆州。原本柔弱多病、备受欺凌的秦婉“性情大变”,不仅懂得治病救人,还能解剖尸体查案,顺便将秦家的姑母、妾身、妾侍刁奴收服。查案过程中,秦婉结识了睿王太子燕迟。燕迟一心要为晋王翻案,这与秦婉想要洗清父亲名誉的目标不谋而合。两人一同返回京城,并在途中联手侦破了各种离奇重大案件。回京后,一具意外发现的骷髅让晋王案再次被提起,燕池和秦婉慢慢接近案件真相,发现了宫中隐藏的惊天秘密。